R help es - Apr 2013 - R3 install.packages('', dependencies=TRUE)

Hola a todos

Les consulto por lo siguiente: hoy aparece en la actualización de mi
sistema (linux open suse) la versión de R 3.

Como de costumbre, informa la actualización, aceptas o rechazas, yo
acepte, aparece la barrita de estado y al finalizar R 3 está en mi
computadora.

Al solicitar una librería informa que esta está realizada en una versión
anterior a la 3, que debo reinstalarla.

Por ejemplo lme4 se instala sin inconvenientes.

Otras tiene dependencias entre paquetes, entonces uso por ejemplo

install.packages('agridat', dependencies=TRUE)

Pero me da la impresión (y más allá del ejemplo del agridat) que hay
dependencias que dependen de otras, o algo por el estilo que hace que no
se instalen todas las necesarias, por ejemplo Rcmdr da trabajo, anda,
pero creo que deberían cargarse más librerías (como que me pide menos
que antes).

¿Hay alguna forma de instalar las dependencias en forma automática, o
alternativa en R 3?

Javier Marcuzzi

Hola,
Lo que yo hice fue copiar todas las librerías de R de la versión
anterior (al instalar como usuario las tenía en
~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15/) y luego hacer:

update.packages(checkBuilt=TRUE)

Yo lo hice realmente así: update.packages(checkBuilt=TRUE,ask=FALSE)

Espero que te sirva,
Olmo.

El Wed, 10 Apr 2013 11:10:45 -0300
Javier Rubén Marcuzzi <javier.ruben.marcuzzi en gmail.com>
escribió:
> Hola a todos
> 
> Les consulto por lo siguiente: hoy aparece en la actualización de mi
> sistema (linux open suse) la versión de R 3.
> 
> Como de costumbre, informa la actualización, aceptas o rechazas, yo
> acepte, aparece la barrita de estado y al finalizar R 3 está en mi
> computadora.
> 
> Al solicitar una librería informa que esta está realizada en una
> versión anterior a la 3, que debo reinstalarla.
> 
> Por ejemplo lme4 se instala sin inconvenientes.
> 
> Otras tiene dependencias entre paquetes, entonces uso por ejemplo
> 
> install.packages('agridat', dependencies=TRUE)
> 
> Pero me da la impresión (y más allá del ejemplo del agridat) que hay
> dependencias que dependen de otras, o algo por el estilo que hace que
> no se instalen todas las necesarias, por ejemplo Rcmdr da trabajo,
> anda, pero creo que deberían cargarse más librerías (como que me pide
> menos que antes).
> 
> ¿Hay alguna forma de instalar las dependencias en forma automática, o
> alternativa en R 3?
> 
> Javier Marcuzzi
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