thr3ads.net - R help es - [R-es] Secuencias de ficheros [Apr 2012]

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J. Miguel Marin

2012-Apr-20 17:33 UTC

[R-es] Secuencias de ficheros

Hola,

tengo que leer más de 2000 ficheros en un programa largo de estimación 
sobre imágenes médicas, con una estructura como ésta:

desde "IM-0005-0001.dcm" hasta "IM-0005-2021.dcm"

Si hago esto:

ui <- NULL
for (i in 1:8){
	ui[i] <- paste("IM-0005-", i,".dcm", sep="")
}
ui

Obtendría:

[1] "IM-0005-1.dcm" "IM-0005-2.dcm"
"IM-0005-3.dcm" "IM-0005-4.dcm"
[5] "IM-0005-5.dcm" "IM-0005-6.dcm"
"IM-0005-7.dcm" "IM-0005-8.dcm"


pero el problema es que necesito justo formatos del tipo 0001, 0002, 
0003... no del tipo 1, 2, 3...

¿Sabeis cómo hacerlo?

Y un saludo a tod en s

jm~

_______________________________

        J. Miguel Marin

http://www.est.uc3m.es/jmmarin

    Dep. of Statistics
University Carlos III of Madrid
        Spain (E.U.)

Carlos J. Gil Bellosta

2012-Apr-20 17:52 UTC

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[R-es] Secuencias de ficheros

x <- paste( "00000", 1:10, sep = "" )
fin <- nchar(x)
inicio <- fin - 5
substr(x, inicio, fin)

Un saludo,

Carlos J. Gil Bellosta
http://www.datanalytics.com

El día 20 de abril de 2012 19:33, J. Miguel Marin
<jmmarin en est-econ.uc3m.es> escribió:>
> Hola,
>
> tengo que leer más de 2000 ficheros en un programa largo de estimación
sobre
> imágenes médicas, con una estructura como ésta:
>
> desde "IM-0005-0001.dcm" hasta "IM-0005-2021.dcm"
>
> Si hago esto:
>
> ui <- NULL
> for (i in 1:8){
>        ui[i] <- paste("IM-0005-", i,".dcm",
sep="")
> }
> ui
>
> Obtendría:
>
> [1] "IM-0005-1.dcm" "IM-0005-2.dcm"
"IM-0005-3.dcm" "IM-0005-4.dcm"
> [5] "IM-0005-5.dcm" "IM-0005-6.dcm"
"IM-0005-7.dcm" "IM-0005-8.dcm"
>
>
> pero el problema es que necesito justo formatos del tipo 0001, 0002,
0003...
> no del tipo 1, 2, 3...
>
> ¿Sabeis cómo hacerlo?
>
> Y un saludo a tod en s
>
> jm~
>
> _______________________________
>
>       J. Miguel Marin
>
> http://www.est.uc3m.es/jmmarin
>
>   Dep. of Statistics
> University Carlos III of Madrid
>       Spain (E.U.)
>
> _______________________________________________
> R-help-es mailing list
> R-help-es en r-project.org
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es

J. Miguel Marin

2012-Apr-20 17:57 UTC

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[R-es] Secuencias de ficheros

Hola,

muchas gracias por la respuesta tan rápida :D

También he seguido investigando el asunto un rato más y encontré otra 
solución:

ui <- NULL
for (i in 1:2020){
	ui[i] <- paste("IM-0005-", sprintf("%04.0f", i),
".dcm", sep="")
}
ui

La cuestión parece que es usar formato tipo "C" en la salida.

Y de nuevo muchas gracias

> x <- paste( "00000", 1:10, sep = "" )
> fin <- nchar(x)
> inicio <- fin - 5
> substr(x, inicio, fin)
>
> Un saludo,
>
> Carlos J. Gil Bellosta
> http://www.datanalytics.com
>
> El día 20 de abril de 2012 19:33, J. Miguel Marin
> <jmmarin en est-econ.uc3m.es> escribió:
>>
>> Hola,
>>
>> tengo que leer más de 2000 ficheros en un programa largo de estimación
sobre
>> imágenes médicas, con una estructura como ésta:
>>
>> desde "IM-0005-0001.dcm" hasta "IM-0005-2021.dcm"
>>
>> Si hago esto:
>>
>> ui <- NULL
>> for (i in 1:8){
>>        ui[i] <- paste("IM-0005-", i,".dcm",
sep="")
>> }
>> ui
>>
>> Obtendría:
>>
>> [1] "IM-0005-1.dcm" "IM-0005-2.dcm"
"IM-0005-3.dcm" "IM-0005-4.dcm"
>> [5] "IM-0005-5.dcm" "IM-0005-6.dcm"
"IM-0005-7.dcm" "IM-0005-8.dcm"
>>
>>
>> pero el problema es que necesito justo formatos del tipo 0001, 0002,
0003...
>> no del tipo 1, 2, 3...
>>
>> ¿Sabeis cómo hacerlo?
>>
>> Y un saludo a tod en s
>>
>> jm~
>>
>> _______________________________
>>
>>       J. Miguel Marin
>>
>> http://www.est.uc3m.es/jmmarin
>>
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>> University Carlos III of Madrid
>>       Spain (E.U.)
>>
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>



jm~

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http://www.est.uc3m.es/jmmarin

    Dep. of Statistics
University Carlos III of Madrid
        Spain (E.U.)

Jorge I Velez

2012-Apr-20 17:59 UTC

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[R-es] Secuencias de ficheros

Hola Miguel,

Podrias usar

formatC(1:10, width = 6, flag = "0")
#[1] "000001" "000002" "000003" "000004"
"000005" "000006" "000007"
"000008" "000009"
# [10] "000010"

Un saludo,
Jorge.-

2012/4/20 J. Miguel Marin <>
>
> Hola,
>
> tengo que leer más de 2000 ficheros en un programa largo de estimación
> sobre imágenes médicas, con una estructura como ésta:
>
> desde "IM-0005-0001.dcm" hasta "IM-0005-2021.dcm"
>
> Si hago esto:
>
> ui <- NULL
> for (i in 1:8){
>        ui[i] <- paste("IM-0005-", i,".dcm",
sep="")
> }
> ui
>
> Obtendría:
>
> [1] "IM-0005-1.dcm" "IM-0005-2.dcm"
"IM-0005-3.dcm" "IM-0005-4.dcm"
> [5] "IM-0005-5.dcm" "IM-0005-6.dcm"
"IM-0005-7.dcm" "IM-0005-8.dcm"
>
>
> pero el problema es que necesito justo formatos del tipo 0001, 0002,
> 0003... no del tipo 1, 2, 3...
>
> ¿Sabeis cómo hacerlo?
>
> Y un saludo a tod@s
>
> jm~
>
> ______________________________**_
>
>       J. Miguel Marin
>
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>   Dep. of Statistics
> University Carlos III of Madrid
>       Spain (E.U.)
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> R-help-es@r-project.org
>
https://stat.ethz.ch/mailman/**listinfo/r-help-es<https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es>
>
	[[alternative HTML version deleted]]

José Antonio Palazón Ferrando

2012-Apr-22 15:37 UTC

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[R-es] Secuencias de ficheros

Llego tarde pero para completar el tres,
os muestro lo que utilizo (vale siempre
que no useis windoze ;-):


system("seq -w 1 2500",intern=T)

Es corto a la par que elegante y se basa
en la orde 'seq' de linux que me saca de
muchos apuros.

Saludos


El 20/04/12 19:33, J. Miguel Marin escribió:>
> Hola,
>
> tengo que leer más de 2000 ficheros en un programa largo de estimación 
> sobre imágenes médicas, con una estructura como ésta:
>
> desde "IM-0005-0001.dcm" hasta "IM-0005-2021.dcm"
>
> Si hago esto:
>
> ui <- NULL
> for (i in 1:8){
>     ui[i] <- paste("IM-0005-", i,".dcm",
sep="")
> }
> ui
>
> Obtendría:
>
> [1] "IM-0005-1.dcm" "IM-0005-2.dcm"
"IM-0005-3.dcm" "IM-0005-4.dcm"
> [5] "IM-0005-5.dcm" "IM-0005-6.dcm"
"IM-0005-7.dcm" "IM-0005-8.dcm"
>
>
> pero el problema es que necesito justo formatos del tipo 0001, 0002, 
> 0003... no del tipo 1, 2, 3...
>
> ¿Sabeis cómo hacerlo?
>
> Y un saludo a tod en s
>
> jm~
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José Antonio Palazón Ferrando
Profesor Titular. Departamento de Ecología e Hidrología.
Facultad de Biología. Universidad de Murcia.
Campus Universitario de Espinardo
30100 MURCIA-SPAIN
Telf: +34 968 36 49 80
Fax : +34 968 36 39 63
Email: palazon en um.es

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