Buenos días: Estoy tratando de hacer una suavización de tasas de mortalidad; para ello me han indicado que debo utilizar el paquete "INLA" de R.... hasta ahí bien, eso sí, ya no sé seguir, ni como tengo que poner los datos, ni que es lo que tengo que introducir ni de que forma.... ¿Alguien podría echarme una mano? Me imagino que tendré que utilizar el vector de tasas a suavizar, y la "matriz de vecindad" (que provincias limitan con cuales...) pero no sé si necesito algo más ni que función de todas debería utilizar. He mirado ya alguna funciones, y creo que tendría que utilizar alguna de las de Besag, pero los ejemplos que vienen no me solucionan nada. Un saludo, y gracias de antemano; Pablo Pueyo ************************* AVISO LEGAL ************************* Este mensaje electrónico está dirigido exclusivamente a sus destinatarios, pudiendo contener documentos anexos de carácter privado y confidencial. Si por error, ha recibido este mensaje y no se encuentra entre los destinatarios, por favor, no use, informe, distribuya, imprima o copie su contenido por ningún medio. Le rogamos lo comunique al remitente y borre completamente el mensaje y sus anexos. El Instituto de Salud Carlos III no asume ningún tipo de responsabilidad legal por el contenido de este mensaje cuando no responda a las funciones atribuidas al remitente del mismo por la normativa vigente. [[alternative HTML version deleted]]
miguel.angel.rodriguez.muinos en sergas.es
2012-Apr-12 11:51 UTC
[R-es] INLA- Suavización de tasas (Smooth)
Hola Pablo. Por si te sirve de algo... Yo he trabajado con BRugs (http://cran.es.r-project.org/web/packages/BRugs/index.html) que te permite utilizar OpenBUGS (versión de código abierto de WinBUGS) desde R. Si quieres usar directamente WinBUGS desde R, puedes hacerlo a través de R2WinBUGS (http://cran.r-project.org/web/packages/R2WinBUGS/vignettes/R2WinBUGS.pdf) El procedimiento (en cualquiera de los dos casos) no es complicado, pero al principio es un poco lioso.... Tienes que cargar el modelo (y comprobar su sintaxis), luego cargar los datos, después establecer el número de simulaciones a realizar, compilar el modelo, establecer los valores iniciales, simular, verificar convergencia, ver resultados, ... Te paso esta URL de un material de Virgilio (hola Virgilio!) que me parece MUY bueno. http://www.bias-project.org.uk/ASDARcourse/unit8_slides.pdf Un Saludo, ________________________________________________________ Miguel Ángel Rodríguez Muíños Dirección Xeral de Innovación e Xestión da Saúde Pública Consellería de Sanidade Xunta de Galicia http://dxsp.sergas.es _______________________________________________________ -----Mensaje original----- De: r-help-es-bounces en r-project.org [mailto:r-help-es-bounces en r-project.org] En nombre de ppueyo en isciii.es Enviado el: jueves, 12 de abril de 2012 12:22 Para: Lista R Asunto: [R-es] INLA- Suavización de tasas (Smooth) Buenos días: Estoy tratando de hacer una suavización de tasas de mortalidad; para ello me han indicado que debo utilizar el paquete "INLA" de R.... hasta ahí bien, eso sí, ya no sé seguir, ni como tengo que poner los datos, ni que es lo que tengo que introducir ni de que forma.... ¿Alguien podría echarme una mano? Me imagino que tendré que utilizar el vector de tasas a suavizar, y la "matriz de vecindad" (que provincias limitan con cuales...) pero no sé si necesito algo más ni que función de todas debería utilizar. He mirado ya alguna funciones, y creo que tendría que utilizar alguna de las de Besag, pero los ejemplos que vienen no me solucionan nada. Un saludo, y gracias de antemano; Pablo Pueyo Nota: A información contida nesta mensaxe e os seus posibles documentos adxuntos é privada e confidencial e está dirixida únicamente ó seu destinatario/a. Se vostede non é o/a destinatario/a orixinal desta mensaxe, por favor elimínea. A distribución ou copia desta mensaxe non está autorizada. Nota: La información contenida en este mensaje y sus posibles documentos adjuntos es privada y confidencial y está dirigida únicamente a su destinatario/a. Si usted no es el/la destinatario/a original de este mensaje, por favor elimínelo. La distribución o copia de este mensaje no está autorizada. See more languages: http://www.sergas.es/aviso_confidencialidad.htm
Hola de nuevo: Al parecer no es conveniente que lo haga en Winbugs.... se trata de que lo consiga con R.... he estado mirando los ejemplos, y ya me voy enterando un poco más de por donde van los tiros; aún así en el ejemplo "Germany" cuando abro los datos, no entiendo una de las variables que utiliza; sé que una es el codigo del territorio, está la amtriz de vecindades, los esperados, y los observados, pero "x" no sé que puede ser.... y tampoco hay nada explicado respecto a ello. Os pego el link, para ver si alguien ya ha trabajado con eso, o me sabe contestar la duda. http://www.r-inla.org/examples/volume-1 (ejemplo "bym") Un saludo, y muchas gracias! ----- Mensaje original ----- De: miguel.angel.rodriguez.muinos@sergas.es Para: ppueyo@isciii.es, r-help-es@r-project.org Enviado: 12/04/2012 11:51:16 Asunto: RE: [R-es] INLA- Suavización de tasas (Smooth) Hola Pablo. Por si te sirve de algo... Yo he trabajado con BRugs (http://cran.es.r-project.org/web/packages/BRugs/index.html) que te permite utilizar OpenBUGS (versión de código abierto de WinBUGS) desde R. Si quieres usar directamente WinBUGS desde R, puedes hacerlo a través de R2WinBUGS (http://cran.r-project.org/web/packages/R2WinBUGS/vignettes/R2WinBUGS.pdf) El procedimiento (en cualquiera de los dos casos) no es complicado, pero al principio es un poco lioso.... Tienes que cargar el modelo (y comprobar su sintaxis), luego cargar los datos, después establecer el número de simulaciones a realizar, compilar el modelo, establecer los valores iniciales, simular, verificar convergencia, ver resultados, ... Te paso esta URL de un material de Virgilio (hola Virgilio!) que me parece MUY bueno. http://www.bias-project.org.uk/ASDARcourse/unit8_slides.pdf Un Saludo, ________________________________________________________ Miguel Ángel Rodríguez Muíños Dirección Xeral de Innovación e Xestión da Saúde Pública Consellería de Sanidade Xunta de Galicia http://dxsp.sergas.es _______________________________________________________ -----Mensaje original----- De: r-help-es-bounces@r-project.org [mailto:r-help-es-bounces@r-project.org] En nombre de ppueyo@isciii.es Enviado el: jueves, 12 de abril de 2012 12:22 Para: Lista R Asunto: [R-es] INLA- Suavización de tasas (Smooth) Buenos días: Estoy tratando de hacer una suavización de tasas de mortalidad; para ello me han indicado que debo utilizar el paquete "INLA" de R.... hasta ahí bien, eso sí, ya no sé seguir, ni como tengo que poner los datos, ni que es lo que tengo que introducir ni de que forma.... ¿Alguien podría echarme una mano? Me imagino que tendré que utilizar el vector de tasas a suavizar, y la "matriz de vecindad" (que provincias limitan con cuales...) pero no sé si necesito algo más ni que función de todas debería utilizar. He mirado ya alguna funciones, y creo que tendría que utilizar alguna de las de Besag, pero los ejemplos que vienen no me solucionan nada. Un saludo, y gracias de antemano; Pablo Pueyo Nota: A información contida nesta mensaxe e os seus posibles documentos adxuntos é privada e confidencial e está dirixida únicamente ó seu destinatario/a. Se vostede non é o/a destinatario/a orixinal desta mensaxe, por favor elimínea. A distribución ou copia desta mensaxe non está autorizada. Nota: La información contenida en este mensaje y sus posibles documentos adjuntos es privada y confidencial y está dirigida únicamente a su destinatario/a. Si usted no es el/la destinatario/a original de este mensaje, por favor elimínelo. La distribución o copia de este mensaje no está autorizada. See more languages: http://www.sergas.es/aviso_confidencialidad.htm ************************* AVISO LEGAL ************************* Este mensaje electrónico está dirigido exclusivamente a sus destinatarios, pudiendo contener documentos anexos de carácter privado y confidencial. Si por error, ha recibido este mensaje y no se encuentra entre los destinatarios, por favor, no use, informe, distribuya, imprima o copie su contenido por ningún medio. Le rogamos lo comunique al remitente y borre completamente el mensaje y sus anexos. El Instituto de Salud Carlos III no asume ningún tipo de responsabilidad legal por el contenido de este mensaje cuando no responda a las funciones atribuidas al remitente del mismo por la normativa vigente. [[alternative HTML version deleted]]