similar to: ver el código de randomForest

Hola: No se muy bien si es esto lo que preguntas, pero el código de todos los scripts está en el fichero: https://cran.r-project.org/src/contrib/randomForest_4.7-1.1.tar.gz Saludos. On Sun, 19 Mar 2023 04:35:44 +0100 Manuel Mendoza <mmendoza en fulbrightmail.org> wrote: > Buenos días, ¿cómo podría ver el código con el que el paquete randomForest > hace el random forest? >

Buenos días: Otra opción es escribir directamente el nombre de la función en la consola de R: > randomForest function (x, ...) UseMethod("randomForest") En este caso, la función randomForest() llama a UseMethod() para seleccionar el método adecuado. Podemos ver los métodos para randomForest con la función methods(): > methods(randomForest) [1] randomForest.default*

Gracias Carlos. No uso caret, pero lo miraré. Quoting Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es>: > Hola, > > Creo que si utilizas "caret" y en la función "trainControl()" defines "oob" > como criterio de randomización, puedes luego recuperar del objeto del > modelo, las predicciones individuales... > > Saludos, > Carlos Ortega >

Muy buenas, ¿sabe alguien cómo obtener las predicciones sobre el out of bag que hace randomForest? Manuel . -- Dr Manuel Mendoza Department of Biogeography and Global Change National Museum of Natural History (MNCN) Spanish Scientific Council (CSIC) C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID Spain

Gracias Emilio y Jorge. Tengo que explicarlo mejor. Mostrando a una audiencia cómo hacer un tipo de análisis, se hace un loop (abajo) que analiza un mapa por regiones longitudinales. Tal y como está el script, print(i) te indica la longitud por la que va (de 10º en 10º) pero me gustaría que en vez de eso te fuese representando una línea vertical sobre el mapa, que he representado previamente con

Buenas tardes. Tengo una base de datos con 3200 variables. El nombre de todas ellas tiene un punto. Por ej., Canis.aureus. ¿Es posible cambiar ese punto por un espacio, en todas ellas, de forma automática? Esa quedaría así: Canis aureus Gracias [[alternative HTML version deleted]]

Vuelvo al ataque, pues ya os lo pregunté. Javier Rubén me dió una posible explicación, pero finalmente no me resolvió el problema. Así que lo vuelvo a intentar, a ver si hay más suerte. Si hago, p.e., i = 1 y corro las 2 filas de dentro del loop que pongo abajo, me abre una ventana y me hace el partial() de frg, es decir, lo hace bien, pero si corro todo el loop, me abre las 9 ventanas (de 9

No sé muy bien, Carlos, como hacerlo, pero no parece más sencillo que lo de multiplicar por 2 los positivos y después editar el mapa. De lo que decías, Emilio, de cambiar el color del punto central creo que haría más confusa la interpretación. El vie., 20 sept. 2019 a las 10:33, Carlos Ortega (<cof en qualityexcellence.es>) escribió: > Hola, > > Una alternativa que suele

Buenas tardes, quedarme con las muestras de una BD (data) que están presentes en otra (datax), cuando se tiene una variable que nunca se repite (Key) es fácil: data <- subset(data,data$Key %in% datax$Key). Mi problema es cuando la exclusividad viene dada por dos variables. P.e., las coordenadas de un mapa: lon y lat. ¿Como puedo quedarme con las muestras de una df cuya lon y lat son iguales a

Buenos días ¿sabéis si hay alguna forma de añadir una recta vertical sobre un mapa hecho previamente con ggplot? Lo que hago ahora es cargar nuevamente el mapa con la línea añadida (una serie de líneas añadidas secuencialmente en un loop) pero me gustaría que añadiese las líneas sin cargar nuevamente el mapa. Gracias, Manuel [[alternative HTML version deleted]]

En mi caso a veces funciona ctr+alt+Z. El mié., 19 ago. 2020 21:46, Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es> escribió: > Hola Manuel, > > En Mac son otra combinación, pero sí que funcionan. > RStudio tiene un grupo de soporte (más bien es una Community) donde podrías > comentarlo por si es un bug. > > Saludos, > Carlos Ortega > www.qualityexcellence.es >

Esta vez no es un problema, pero quizás podáis aconsejarme sobre qué gráfico elegir, pues hice algunas pruebas y no queda muy bien. Quiero comparar 9 rectas (o lo que sea) hechas de tan solo dos puntos. Para 9 grupos de especies distintos tengo un dato para 2050 y otro para 2070, y pretendo que se aprecie bien la evolución (de tan solo dos fechas) de cada uno de los 9 grupos, y las diferencias

Gracias Emilio. Si, son asimétricos porque se mueven en rangos distintos. De hecho, miden cosas distintas, pero una muestra no puede ser positiva y negativa a la vez. Me planteo multiplicar las positivas por 2 y al editar el mapa corregirlo para que indique los valores reales. Eso funcionaría, pero son muchos mapas y quizás haya una función en ggplot que evite el problema directamente. Manuel El

Muchas gracias Carlos; ¡tu siempre al pié del cañón! (lo puse el día de reyes a la 1.20h y me contestas a las 2.45h) Una cosa más: si el eje y es la probabilidad ¿por qué va de 0 a 10? En un RF para clasificación me da valores parecidos a los de tu ejemplo, y en otro para regresión, valores de y entre 45 y 55. Para regresión, el último parámetro no puede ser una categoría, como

Buenas tardes. Más bien una curiosidad. Echaba de menos poder rehacer con *Ctrl y* lo deshecho con *Ctrl z*. Lo curioso es que RStudio, desde hace un tiempo, en la pestaña *Edit*, al lado de *Redo *pone "*Ctrl y", *pero *Ctrl y* no funciona. ¿sabe alguien por qué? Gracias, Manuel [[alternative HTML version deleted]]

Buenas tardes. Tenía la versión 3.6.0 de R. Quería instalar el paquete edarf, pero decía que no estaba disponible para esa versión. Actualicé R a la versión 4.0.0, que creo que es la última, pero al tratar de reinstalar forestFloor, me dice que no está disponible para la versión 4.0.0. He abierto R 3.6.0 directamente, cliqueo install.packages("forestfloor") y ahora me dice que no está

Buenas tardes, tengo una variable bimodal (*var)*, de presencias y ausencias (1s y 0s) y otra variable, *prob*, con las probabilidades que le asigna un modelo (entre 0 y 1). Con: *ggplot(Preds, aes(x=prob, fill= var )) + geom_density(alpha=.3)* obtengo la distribución de las presencias y de las ausencias, por separado, en función del valor de probabilidad asignado. Las dos curvas se cruzan en un

Buenos días. Tengo dos mapas que hago con ggplot (abajo) y necesito superponer el 2º al 1º. En el 1º se representa la variable PA, binomial (0, 1), en gris, y en el 2º la variable ExtTG7085, que es numérica y va de 0 a 200. La 2ª es un gradiente en rojo. Lo ideal sería que donde coinciden el rojo de la 2ª se viera más oscuro, pero supongo que eso no es fácil. Podría también ser en otro color, pero

Buenos días. Hago mis mapas con el código que os copio abajo, pero me gustaría que me dibujase las líneas del mapa después de poner los puntos para que se vean. Puedo hacer los puntos más pequeños, pero entonces quedan separados y yo quiero que rellenen el mapa. Gracias, como siempre, Manuel print(ggplot(legend=FALSE)+geom_path(data=map_data('world'), aes(x=long,

Hola erreros. A ver si alguien podría decirme qué son los dos ejes del plot que resulta de aplicar partialPlot en un Randomforest. Encuentro que: Partial dependence plot gives a graphical depiction of the marginal effect of a variable on the class probability (classification) or response (regression) que nos indica como varía la VR en función de la variable considerada, manteniendo el