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2011 Mar 01
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Distintos soft
Les consulto por lo siguiente: Se me ocurrió usar datos de MCMCglmm en otros procedimientos de R, comparar los resultados y el tiempo como facilidad de uso, para lo cual use LME4, los resultados fueron parecidos, entendiendo que internamente los algoritmos tienen diferencias, es lógico que los resultados no coincidan exactamente, pero aproximadamente tienen que ser compatibles, en este caso
2015 Apr 30
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predict nlme
Estimado Oliver Nuñez Envío un ejemplo reproducible. Javier Marcuzzi # de donde tomo datos, y tiene el modelo (en el pdf) library(MCMCglmm) # librería con las funciónes que voy a usar library(nlme) datos0<-ChickWeight # creo algunos datos que agrego a los origonales Factor<-as.numeric(datos0$Chick) Factor[Factor > 0 & Factor <= 10] <- 'A' Factor[Factor > 10
2012 Sep 18
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Formula in a data-frame
Hello all, I'm new in R, and I have a data-frame like this (dput information below): Specie Fooditem Occurrence Volume 1 Schizodon vegetal 1 0.05 2 Schizodon sediment 1 0.60 3 Schizodon vegetal 1 0.15 4 Schizodon alga 1 0.05 5 Schizodon sediment 1 0.90 6 Schizodon
2015 Apr 28
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Resumen diseño sencillo
Estimado Carlos Ortega Muchas gracias, al ver su correo recordé por donde estaba eso muy fácil, copio y pego la solución, era tan fácil que no lo recordaba. > table(d) , , Etablecimiento = Est1 Factor Dieta A B 1 220 0 2 0 120 3 0 0 4 0 0 , , Etablecimiento = Est2 Factor Dieta A B 1 0 0 2 0 0 3 0 120 4 0 118
2008 Feb 21
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Unable to create/index a zoo irregular timeseries
In the text file pressione2008.csv I have the following "Data","MAX","MIN","Note" "07-01-2008 08:00:00", 135, 90, "Eccessi feste, inizio dieta" "07-01-2008 18:00:00", 135, 85, "" "08-01-2008 08:00:00", 125, 75, "" which is a collection of blood pressure data at different time of the day. I would
2015 Apr 30
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predict nlme
Estimados Tengo un error que me desconcierta, es un código que simplifiqué de otro trabajo donde no hay problemas, sin embargo me da un error. Una diferencia es que en mi otro trabajo uso spline y ahora polinomio, este es de segundo grado y se encuentra tanto en efectos fijos como aleatorios, el modelo es correcto, corre con MCMCglmm pero no con nlme. grid <- expand.grid(Tiempo=4:6,
2014 Jan 14
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Duda Regresión Multiple
Buenos días, *Muchas gracias, todas las aportaciones han sido bien útiles.* Las he tenido en cuenta y he pasado los datos con el R, siguiendo el siguiente comando: *modeloRTUN2<-lm(AVE.~ Tariff + d1 + d2 + d3 + d4 + d5 + d6 + d7 + d8 + d9+ d10 + d11+ d12+ d13+ d14+ d15+ d16+ d17+ d18+ d19+ d20 +d21 + Tariff*d1 + Tariff*d2 + Tariff*d10)* *summary(modeloRTUN2)* Siendo: AVE. = Variable
2008 Jun 15
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multilevel basic lme question
Hi R users I want to use the lme package for a multilevel analysis on the following example: > math<-c(2, 3,2, 5, 6 ,7 , 7) > sex<-c(1, 2, 1, 2, 2, 2, 1) > school_A<-c(1,1,1,2,2,2,2) > school_B<-c(10,10,10,20,20,20,20) > mydata<-data.frame(math, sex, school_A, school_B) > mydata School_A and school_B are two different school characteristics, math is an
2015 Apr 28
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Resumen diseño sencillo
Estimados Estoy realizando algo tan sencillo que no se que forma sería la más apropiada, la situación es la siguiente, hay un data.frame con unos 500 registros, con algunas variables de las cuáles me interesa marcar solo tres, o dicho de otra forma, me interesan tres columnas, de las cuáles cada una tiene entre dos y cuatro factores. Nada complicado, me interesa colocar la combinación de los
2003 Mar 12
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quasipoisson, glm.nb and AIC values
Dear R users, I am having problems trying to fit quasipoisson and negative binomials glm. My data set contains abundance (counts) of a species under different management regimens. First, I tried to fit a poisson glm: > summary(model.p<-glm(abund~mgmtcat,poisson)) Call: glm(formula = abund ~ mgmtcat, family = poisson) . . . (Dispersion parameter
2013 Jun 02
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Como hacer el promedio de la suma de varias filas
Hola a todos, queria saber si existe un comando que me permita sumar filas agrupandolas o algo asi y luego sacarle el promedio a eso. Tengo una matriz de datos con varias escuelas, cada escuela tiene distintos salones de clases, algunas 2 otras tres etc, y cada salon de clases tiene un numero de alumnos, lo que quiero es calcular el promedio de alumnos por escuela, y el promedio de salones por
2017 Jul 23
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Suma de columna en data.frame con restricciones
Buen día, Tengo un data frame con los siguientes datos > Sexo<-c(1,1,1,2,2,2,2,1) > edad<-c(10,12,15,12,10,15,12,15) > frec<-c(150,125,147,123,156,174,185,195) > df<-data.frame(Sexo,edad,frec) Quisiera saber como elaborar una tabla en la cual seleccione el sexo y la edad y R realice la suma de la frecuencia debido a que la lista original incluye miles de
2010 Oct 13
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Wierd nlm behaviour in 2.10.1 and 2.12.0 [Sec=Unclassified]
Hi all, When upgrading to 2.11.1 recently I noticed different results being produced by my code. After much digging I have finally narrowed it to a call to nlm(). This can be replicated by: FixedRemovals<-1836180125888 AbStageInitial<-2223033830403 Rates<- 0.3102445 nlm(function(rootM,Abund,Loss,OtherM) {(Loss-(rootM/(rootM+OtherM)* (1-exp(-(rootM+OtherM)))*
2000 Jul 21
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confint() error
Dear all, I have run the confint() function according to below and I get the following error message: > confint(stepAIC.glm.spe.var.konn2.abund, level=0.95) Waiting for profiling to be done... Error: missing value where logical needed In addition: Warning message: NaNs produced in: sqrt((fm$deviance - OriginalDeviance)/DispersionParameter) or > confint(stepAIC.glm.spe.var.konn2.abund,
2011 Nov 09
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Help with tryCatch with a for loop
Hello all, I'm a beginner in R working on a script that will produce a set of models (linear, polynomial and logistic) for each location in a dataset. However, the self-starting logistic model often fails - if this happens I would like to just skip to the next iteration of the loop using tryCatch. I've looked at a few examples and read the help file, but didn't understand tryCatch
2023 Jan 18
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Suma de datos de una tabla
No sé si olvidé aclarar, pero quiero crear una lista para cada columna y así almacenar esos valores. On Wed, 18 Jan 2023 at 14:13, David Camilo Gomez Medina < dcgomezme en unal.edu.co> wrote: > Hola Carlos. > > Por ejemplo la segunda columna (16040050), quiero sumar todos los datos de > esa columna correspondientes al año 2000 (quiero relacionarlos con la > primera columna
2024 Feb 19
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Samba omitting the user group setting, might be a bug
Mandi! Fyodor Kravchenko via samba In chel di` si favelave... > Thank you, nesting is set to 1. Is there anything else we could check? AFAIK, no. Next step is use a privileged container, but really in this vase better using a VM. -- Berlusconi: "Da oggi sono a dieta" Il Paese lo ? gi? da 4 anni (Il Ruggito del Coniglio)
2008 Aug 17
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before-after control-impact analysis with R
Hello everybody, In am trying to analyse a BACI experiment and I really want to do it with R (which I find really exciting). So, before moving on I though it would be a good idea to repeat some known experiments which are quite similar to my own. I tried to reproduce 2 published examples but without much success. The first one in particular is a published dataset analysed with SAS by
2008 Mar 04
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Plot with two different coloured regression lines and legend
It is a trivial problem, but in the book I couln`t figure out how to put different colours at different regression lines plot(bif,abund,type="n", xlab= "number_bifurcations", ylab="abundances") sbif<-split(bif,stage) sabund<-split(abund,stage) points(sabund[[2]],sbif[[2]],pch=16, col="red") for(i in 1:2) abline(lm(sabund[[i]]~sbif[[i]])) Thanks in
2023 Jan 18
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Suma de datos de una tabla
Hola Carlos. Por ejemplo la segunda columna (16040050), quiero sumar todos los datos de esa columna correspondientes al año 2000 (quiero relacionarlos con la primera columna donde está la fecha) y ese valor almacenarlo en una lista y así sucesivamente con los demás años y con las demás columnas. Tengo pensado una lista así: est_16040050 [[2000]] [1] 2.3 [[2001]] [1] 1.7 [[2002]] [1] 4.8