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2016 Apr 01
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R igraph
Estimado Luisfo Chiroque Hay aristas múltiples, eso es por la preparación de los datos, es que separe por componentes, no me refiero al término componente estadístico, sino a descomposición de algo en los componentes que lo construyen, algunos son comunes y otros no, cuándo son comunes hay una relación en la red. Voy a probar con simplify, cuándo lo leí yo lo descarté, lo releeré, ¿Qué opina de
2015 Dec 02
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igraph o network
Estimados, estoy ?jugando? con unos datos clínicos donde realizo un análisis de redes, utilicé igraph como nerwork, pero finalmente uso igraph (creo que tiene más opciónes). Son algo de 200 nodos y algo más de 2000 relaciones. Puedo graficarlos. Los datos están de la siguiente forma, por ejemplo, individuo, patología, (las dos primeras columnas son la relación), luego un fármaco, el grupo
2016 Sep 06
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igraph edges busqueda
Estimados Tengo una duda E(datos.network)[[inc('LoQueBusco')]] + 20/6795 edges (vertex names): E(datos.network)[E(datos.network)$Cosa=="'LoQueBusco'"] + 78/6795 edges (vertex names): La primer forma es 20/? la segunda 78/? ¿Los resultados no tendrían que ser idénticos? Estos datos son pocos pero me desarman la cabeza. Desde ya muchas gracias. Javier Rubén Marcuzzi
2016 Sep 06
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igraph V a partir de E y subgrafos
Estimado Javier, Me alegra que hayas avanzado con tu error. Te respondo a esto último. La función induced.subgraph() espera como segundo parámetro una lista de los IDs de los vértices, mientras que tú le estás pasando una lista de 'edges'. Prueba lo siguiente: c <- induced.subgraph(datos.network, which(V(datos.network)$name == 'Casa')) Si entendí bien todo, debería
2016 Jun 01
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data.frame colname igraph
Envío el mismo código con un head, observar que el data.frame no es al estilo: degree(datos.network) 1 Ficha 1022 9 2 Ficha 1024 10 > version _ platform x86_64-w64-mingw32 arch x86_64 os mingw32 system x86_64,
2016 Jun 01
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data.frame colname igraph
Si, ese es el problema, lo que implica por ejemplo que no pueda ordenar el data.frame por grados. Javier Rubén Marcuzzi De: JCMld Enviado: miércoles, 1 de junio de 2016 4:28 Para: 'Javier Marcuzzi'; R-help-es en r-project.org Asunto: RE: [R-es] data.frame colname igraph Creo que la conversión a data.frame está devolviendo un data frame con una sola columna llamada
2010 Mar 26
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How to read a xml file?
How to read a xml file? I have this XML source: ------------------------------------------------------- <?xml version="1.0" encoding="UTF-8" standalone="yes"?> <fichas> <ficha> <nombre>Gabriel</nombre> <apellido>Molina</apellido> <direccion>Alfredo Vargas #36</direccion> </ficha>
2016 Aug 29
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encontrar fechas saltadas
Hola a todos: Apliqué el método, pero me salió lo siguiente; error in FUN(X[[i]], ...) : only defined on a data frame with all numeric variables. Me imagino que el error surgió ya que la tabla de valores que necesito encontrar tengo "FECHAS", "HORA" Y NUMERO . Por ejemplo; fecha hora datos 20/11/12 2:00:04 AM 12.905 21/11/12 3:00:04 AM 12.889 22/11/12 4:00:03 AM
2012 Apr 27
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salida informe html
Buenos días, Como resultado final de unos análisis espaciales que hago, genero unos mapas y gráficos. He creado una ficha como esta a mano: http://dl.dropbox.com/u/7026890/CM/RSesmaf.html en la que presento un mapa resultado con los puntos de muestreo y una serie de gráficos de evolución. ¿Sería posible generar algo similar con R? Por ahora lo que he encontrado sería escribir el html línea a
2012 May 29
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community finding in a graph and heatplot
Hi everyone, I am using the fastgreedy.community function to get the $merges matrix and the $modularity vector. This serves my purpose of testing modularity of my graph. But I am "greedy" to plot the heat map and dendrrogram based on the $merges dendogram matrix. I know that heatplot does the graphics part but I am not sure if the dendogram generated by the heatplot will match the one
2016 May 31
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data.frame colname igraph
Estimados Tengo un problema, creo que sencillo, pero hay algo que hice mal, coloco el código, básicamente desde igraph se realiza un análisis, y se me ocurre tener un data.frame para ordenar los resultados, pero justo en ese punto aparece un problema. ¿Alguna sugerencia? > version _ platform x86_64-w64-mingw32 arch x86_64
2018 May 10
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Anuncio: paquete outliers
Estimados colegas: Entiendo que este buzón es el adecuado (me disculpan si no es así) para dar a conocer el siguiente paquete de R: *MUOD (outliers)* luisfo/muod.outliers | | | luisfo/muod.outliers | El paquete, tal y como se indica, está respaldado por un paper que hemos publicado recientemente en Scientific Reports. Detecta outliers en datos multidimensionales usando 'function
2016 Apr 04
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question about probplot in e1071 package
Hello! I am using probplot in the e1071 package and want to do something like the following, only with the the 2nd plot overlaying the first. I can't seem to make it work. Any suggestions? *library(e1071) **x <- rnorm(100, mean=5)* *y <- rnorm(100, mean=3)* *probplot(x, line=FALSE) * *probplot(y, line=FALSE) * *Regards,* *Tom* [[alternative HTML version deleted]]
2016 Sep 03
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igraph V a partir de E y subgrafos
Estimados Tengo un problema. Con igraph creo una red a partir de un data.frame, las dos primeras columnas son V y las restantes E. Hay un trabajo anterior, yo me pregunté ¿Qué pasaría si las cosas hablaran entre ellas?, entonces hay un cruce de información de todos contra todos y elimino los nulos y duplicados. Al ver los listados E, V tienen la información. Hasta ahí estaría todo bien (me
2016 Mar 01
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Juntar dos data.frames eliminando celdas con NA
Hola, Perdonar por saltarme algun paso, pero a veces no me doy cuenta que yo lo tengo muy claro porque soy el que tiene el problemay no termino de explicarlo del todo jeje. Ahora he adjuntado los pasos necesarios en excel para obtener el resultado que quiero , serian 5 pasos: Quizas en R haya otra manera mas rapida. 1) Cargar las dos bases de datos (base de datos ver y base de datos azul)2) Hacer
2014 Feb 16
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permissions not work
Hola, primera vez que escribo pero ya estoy desesperado y creo que ustedes me pueden ayudar... mi ingles es muy malo yo hablo espa?ol... yo instale samba4 en ubuntu 12 y todo anda bien, puedo unir computadoras al dominio y puedo crear usuarios. Mi problema son los permisos, no se como trabajan!! yo necesito que el due?o de la capeta tenga todos los permisos y los demas usuarios puedan ver el
2016 Apr 12
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Dissimilarity matrix and number clusters determination
Hi, I already have a dissimilarity matrix and I am submitting the results to the elbow.obj method to get an optimal number of clusters. Am I reading the below output correctly that I should have 17 clusters? code: top150 <- sampleset[1:150,] {cluster1 <- daisy(top150 , metric = c("gower") , stand = TRUE , type = list(symm
2016 Apr 01
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Gráficos estilo "hecho a mano"
Se ha borrado un adjunto en formato HTML... URL: <https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help-es/attachments/20160401/205f15ae/attachment.html>
2016 Feb 11
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Invertir dcast
Con data.table todo puede ir muy rapido. > require(data.table) > M=matrix(c(5,NA,NA,NA,6,NA,7,NA,8),3,3) > M [,1] [,2] [,3] [1,] 5 NA 7 [2,] NA 6 NA [3,] NA NA 8 > M2=data.table(M) > M2 V1 V2 V3 1: 5 NA 7 2: NA 6 NA 3: NA NA 8 > M3=melt(M2,variable.name = "columna") > M3 columna value 1: V1 5 2: V1 NA 3: V1
2016 Apr 07
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using apply to a data frame
??I would like to apply a function, fract, to the columns of a dataframe. I tried the following apply(data5NonEventEpochs,2,fract) but, no surprise it did not work as apply works on matrices not data frames. How can I apply a fuction to the columns of a data frame? (I can't covert data5NonEventsEpochs to a matrix as it contains character data). Thank you, John John David Sorkin M.D., Ph.D.