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2014 Jun 13
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p values con LMER
Hola Manuel lo he tratado de hacer pero me sale Error: unexpected string constante in: "anova(a,as,test=Chisq") no tengo ni idea de por qué... Me resulta alucinante no poder contar ya con pvals.fnc. ¿Será imposible hacerse con ello? Saludos, Miguel -------------------------------------------- El vie, 13/6/14, Manuel Azcárate <mazcarategarcia en gmail.com> escribió:
2014 Jun 13
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p values con LMER
Existe discusión sobre el uso de los p-valores en modelos mixtos. Como se ha dicho antes, para mi lo más adecuado es comparar modelos mediante la función anova. Por Internet se puede encontrar un buen libro de Douglas Bates y en español, busca modelos mixtos con R de Luis Cayuela, enfocado hacia ecología, pero está muy bien El 13/06/2014 14:00, "Jorge I Velez"
2015 Feb 25
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DUDA LLENAR MATRIZ CREADA
Buena tarde, Estoy llevando a cabo un trabajo y no encuentro la forma de llenar una matriz con el p_value y un estadístico calculado. Un poco mas detallado, tengo muestras aleatorias, calculo por ejemplo la prueba t, wilcoxon, etc y requiero llevar por una parte los p_value de k muestras a una matriz creada anteriormente y por otro lado el valor del estadístico de las mismas k muestras a otra
2020 Oct 18
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Resultado de la consola como un tibble
Buen día estimados Estoy tratando de hacer un tibble con los resultados de un apply que se muestran en la consola que me da R, no estoy seguro si eso se pueda hacer, pero me gustaría organizar los resultados de esa manera. mi código es: data("mtcars") Mtcars_matriz <- as.matrix(mtcars) apply(Mtcars_matriz, MARGIN =2, FUN = shapiro.test) DF2 <- tibble(Variable = NA, W = NA, Pvalue =
2012 Oct 23
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factor or character
Hi, The program below work very well. (snps = c('rs621782_G', 'rs8087639_G', 'rs8094221_T', 'rs7227515_A', 'rs537202_C')) Selec = todos[ , colnames(todos) %in% snps] head(Selec) But, I have a data set with 1.000 columns and I need extract 70 to use (like snps in command above). This 70 snps are in a file. So I create a file to extract them with
2020 Oct 18
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Resultado de la consola como un tibble
Hola, Bueno, puedes hacer el cálculo de una forma mucho más compacta y rápida. Esta forma es especialmente recomendable cuando tienes muchas columnas y muchas filas. > library(data.table) > myDT <- as.data.table(mtcars) > myDTlong <- melt(myDT, measure.vars=1:ncol(myDT)) > myDTlong[ , list(p_value = shapiro.test(value)$p.value, v_stat = shapiro.test(value)$statistic) , by
2012 Aug 15
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Import Data from Excel
Dear all, I want to import just part of an excel data file into R. I would like to have the data imported without rownames or colume names. I used read.delim("clipboard", header=F). Somehow even though I added the argument "header=F", I still have the row names V1, V2, ..., Does anyone know how to fix this? Thanks very much in advance. Hannah [[alternative
2010 Jul 13
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permutation-based FDR
Hola a todos, Tengo un pequeño problemilla... Tengo unas 9000 variables que he contrastado con 1 en concreto con el test de wilcoxon. He calculado el p-valor, y queria corregirlo con el permutation-based FDR. He encontrado una funcion con R comp.fdr()que hace esta corrección, pero te pide que le pongas las variables con las observaciones y te hace el test (según he entendido). Yo solo quiero
2016 Aug 18
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Porcentajes por grupos
Hola Eric. Muchas gracias por tu respuesta. Intenté hacer lo mismo sobre una variable agregada a datos, de modo: datos$p_Valores <- datos[, Valores/sum(Valores), by=MesAño] pero no funciona, porque pega un data.table en una única variable: In `[<-.data.table`(x, j = name, value = value) : Supplied 2 items to be assigned to 5849 items of column 'pValores' (recycled leaving remainder
2011 May 10
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Series temporales
Hola Jorge: Disculpa la tardanza pero me han tenido liado en otros menesteres. Yo no soy ni muchísimo menos un experto ni en series temporales ni en R de hecho retomo el tema después de muchos (demasiados) años aparcado y dedicándome a labores de programación pura y dura. Respecto a la diferencia de resultados con R y Statgraphics, no conozco el proceso de selección del modelo ARIMA que hace
2020 Oct 18
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Resultado de la consola como un tibble
Hola, No hace falta (en este caso) capturarlo de la consola. El resultado de la función apply se puede capturar y procesar. > data("mtcars") > # Mtcars_matriz <- as.matrix(mtcars) > res_out <- apply(mtcars, MARGIN =2, FUN = shapiro.test) > > > res_df <- as.data.frame(unlist(res_out)) > res_df$vars <- rownames(res_df) > rownames(res_df) <- NULL
2016 Aug 17
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Porcentajes por grupos
Hola. Necesito calcular los porcentajes de un valor dado (valores) como porcentaje de la suma de ese mismo valor pero agrupando por una tercera columna (en este caso, podría ser Mes-Año). El resultado sería el que se ve en la var: "EnR" Necesito además que ese resultado quede pegado en mi data.frame. Año Mes AñoMes Factor Valores enR 2015 1 2015-1 a 105 0.25 2015 1 2015-1 b 104 0.24 2015
2016 Mar 28
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Mann-Whitney con datos temporales
Hola a tod en s, queremos hacer una comparación entre dos lugares muy alejados entre sí en relación a la temperatura de cada sitio usando medias horarias de un período determinado. Sólo hay medidas de un sensor en cada sitio y queremos saber si las diferencias son significativas o no entre sitios/curvas. Hemos usado un test de Mann?Whitney U con la función wilcox.test (paired=F) ya que los