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2014 Jun 03
4
Cargar csv de 16GB en R
Estoy de acuerdo con la observación de Joan, yo supe utilizar formas para
trabajar con más memoria de la configurada como base, pero tengamos en
cuenta que una vez importados los datos, cualquier operación estará entre
la memoria física y la virtual, es todo un desafío y dependerá del análisis
estadístico (me refiero a los algoritmos que ordenen al CPU).
Mi experiencia cuándo trabaje con muchos
2014 Jun 04
2
Cargar csv de 16GB en R
Es cierto que R carga los objetos en memoria, pero ésta puede ser memoria
RAM + Virtual.
Yo he trabajado con data frames mayores que la memoria física. Es cierto que
esto ralentiza las operaciones.
Lo que marca realmente los límites de la memoria es la versión del sistema
operativo y de R, que han de ser de 64 bits. En un sistema de 32 bits el
direccionamiento teórico máximo es de 4 Gbytes, pero
2014 Jun 04
3
Cargar csv de 16GB en R
No soy experto en data mining con R, sé que existe algún paquete al respecto, pero no sé si R sería lo más adecuado para cantidades ingentes de datos…
Saludos,
Juan Carmona.
De: Eduardo Bieñkowski [mailto:edukoski@gmail.com]
Enviado el: miércoles, 04 de junio de 2014 17:07
Para: Joan Carmona
CC: Isidro Hidalgo; r-help-es
Asunto: Re: [R-es] Cargar csv de 16GB en R
Si pero que pasaría
2013 Jun 13
4
¿Alguna explicación para este fenómeno? (Relativo al uso de memoria)
Hola, ¿qué tal?
Al final he descubierto el motivo del problema. Cierto que esperaba
cierto nivel de _overhead_, pero nunca tantísimo. Por mucho _overhead_
que haya, no se pasa de 7MB a 5GB.
El problema era que (a pesar de mi opción stringsAsFactors = F) los
niveles de los factores se copiaban íntegros en cada una de las
columnas de tipo factor de cada una de las tablas resultantes. Aunque
no se
2010 Nov 02
8
Una guía de estilo para programar en R... ¿comentarios?
Hola, ¿qué tal?
Hace poco vi que Google había hecho pública su guía de estilo interna
para programar en R:
http://google-styleguide.googlecode.com/svn/trunk/google-r-style.html
Me tomé la libertad de traducirla:
http://datanalytics.com/guia_estilo_r.html
Cuanto más pienso en ella, más carencias veo. Escribí sobre ello en mi
blog (
2013 Jun 13
1
¿Alguna explicación para este fenómeno? (Relativo al uso de memoria)
Javier,
R también tiene opciones de "debug" como la que estás comentando.
Te adjunto un ejemplo práctico:
http://www.burns-stat.com/an-r-debugging-example/?utm_source=rss&utm_medium=rss&utm_campaign=an-r-debugging-example
Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es
El 13 de junio de 2013 21:45, Marcuzzi, Javier Rubén <
javier.ruben.marcuzzi@gmail.com> escribió:
2013 Jun 13
2
¿Alguna explicación para este fenómeno? (Relativo al uso de memoria)
Interesante... y preocupante.
No propuso alguien, no hace mucho, reescribir R desde el principio por
este tipo de cosas?
El 13/06/13 20:04, Carlos Ortega escribió:
> Hola,
>
> Si este comportamiento se ve con cualquier data.frame que luego conviertas
> a lista:
>
>>
>> v <- 1:10
>> w <- split(v, 1:2)
>> w
> $`1`
> [1] 1 3 5 7 9
>
> $`2`
2013 Jun 13
1
¿Alguna explicación para este fenómeno? (Relativo al uso de memoria)
Hola, ¿qué tal?
Lo que quieres es un "debugger visual" (como el de muchos IDEs,
incluyendo Netbeans y Eclipse) para R, como el de Revolution,
http://www.youtube.com/watch?feature=player_embedded&v=7shLKEINM9A#!
Pues sí, efectivamente, existe, pero solo con la versión de
Revolutions de R. Y verás también que está basado en el "debugger"
tradicional de R, que permite
2010 Nov 19
2
help
Hola,
Tengo la base de datos de un censo agropecuario el cual está en
formato de SPSS, cuando cuando ejecuto el comando para introducirlo a
R, despues de permanecer lento R, aparece esto:
Error: cannot allocate vector of size 1.6 Mb
Hasta aquí llega y no introduce ninguna observación. Mi pregunta es si
existe alguna solución, talvez aumentar la memoria de R?? Imagino que
como ustedes han
2009 Jul 28
2
Checking package on Windows (and seemingly irreproducible errors in CRAN checks)
Hello,
I submitted a small package, colbycol, to CRAN. I developed it on Linux
and tested it on my Linux box and another Windows machine. Besides,
other people kindly tested it in their systems.
The package seems to "compile" correctly in r-forge for Windows. In
fact, you can find the binary package at
http://r-forge.r-project.org/R/?group_id=426.
However, in CRAN, the Windows
2013 Dec 09
2
How can I find nonstandard or control characters in a large file?
I have a humongous csv file containing census data, far too big to read into
RAM. I have been trying to extract individual columns from this file using
the colbycol package. This works for certain subsets of the columns, but not
for others. I have not yet been able to precisely identify the problem
columns, as there are 731 columns and running colbycol on the file on my old
slow machine takes
2018 Feb 25
3
Ingesta y preprocesamiento de datos
Buenas,
Quiero hacer una ingesta de datos en una base de datos de un servidor. El proceso es hacer una consulta en la base de datos, que me dice uqe columnas tengo que coger.
Una vez hecha dicha consulta, abrir un csv, coger las columnas que me indicaba esa base de datos y subir el dato concreto del csv a una base de datos.
Estoy pensando en usar Apache Flume o similar, pero es en un servidor
2014 Sep 27
2
recomendación de librerías para mapas en Shiny
Hola
Estoy ahora mismo en el MADData <http://www.maddata.es/>, y en proceso de
hacer un Shiny, quiero meterle un mapa con los puntos de medida del tráfico
y el tráfico. Pero como novato quería ver si me recomendais alguna librería
para hacer mapas y embeberlos en shiny, ya sea googlemaps, leaflet,
cartodb...
y cualquier enlace a buena documentación es muy bien recibido! :-)
Miguel
2013 Sep 27
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RV: cronbach
rm(list = ls()) #borra todo lo anterior en memoria
setwd("G:/Public/Documents/R/EPICALC/") #como se llama la data desde su path
sanda<-read.csv("sandavid2.csv",header=TRUE, sep=",", dec=".")
use(sanda)
attach (sanda)
library (MASS)
label.cronbach <- label.var(p01, "¿Consume mucho pan? ") ####¿Hay alguna manera de nombrarlos
2015 Oct 08
3
Tranformar falsas variables char en numéricas
Hola usuarios de R,
Antes de nada presentarme, soy nuevo en R (antiguo... y bueno actual
usuario de SAS), llevo menos de un mes y estoy intentando empezar con
pequeñas cosas.
Hay un tema que me está llevando bastante tiempo y por más que investigo y
hago pruebas no logro saber como se hace; veréis tengo un data.frame el
cuál tiene bastante variables y todas ellas clasificadas como char, sin
2018 Feb 10
2
Optimizar función
Buenas para tod en s, tengo una consulta para poder optimizar tiempos. Ejemplo
tengo el siguiente dataframe:
distrito<-c("A","A","A","B","B","B","C","C","C","A","A","B","B","C")
2010 Aug 10
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R y la gestión de memoria
Hola, ¿qué tal?
Voy a plantear una pregunta que no creo que sea enteramente
relacionada con R. Incluso pudiera ser una pregunta que tuviera que
ver más con Windows y su gestión de memoria.
Tengo una función foo que toma un argumento numérico y devuelve otro
número. Durante el proceso crea un objeto muy grande.
La llamo muchas veces haciendo algo así como:
resultados <- sapply( entradas, foo
2015 Mar 20
2
Uso de memoria en R.
Hola a todos.
Tengo un problema y quería saber si hay alguna solución más allá de ampliar
la memoria del ordenador.
El caso es que tengo un script en el que voy generando datos... y al final
tengo unos ficheros enormes que tarde o temprano me dan errores de memoria
(en especial cuando los exporto a excel con XLConnect)
Yo suponía que si en R borraba una variable con rm() el espacio de memoria
2017 Jan 03
3
Consulta mapas
Hola!
Quiero empezar a georeferenciar en mapas con R. En blogs se encuentra
bastante información pero veo que no hay unanimidad respecto a las
librerías a utilizar ni tampoco la información es muy clara ni abarcativa.
¿Alguno/a trabaja con mapas en R y me puede indicar por donde encarar?
En principio mi interés es realizar mapas sencillos con información por
provincias y departamentos de
2015 Mar 20
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Uso de memoria en R.
Y aún así veremos si puedes apañarte...
R no es muy buen gestor de memoria.
Además de lo que te ha dicho Carlos, lo mejor es "programar bien", sabiendo
cuando R hace copias de los objetos (cosa que hace muy a menudo), para
evitarlo al máximo.
Otra cosa que puede hacerse es "adelgazar los objetos" si no necesitas mucha
de la información que contienen. Por ejemplo, si haces un