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2013 Oct 01
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Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR
Instalo ade4 correctamente y no me abren los datos como por ejemplo data(bsetal97) ¿Qué piensan de eso? De: r-help-es-bounces en r-project.org [mailto:r-help-es-bounces en r-project.org] En nombre de Francesc Carmona Enviado el: Tuesday, October 01, 2013 7:30 AM Para: r-help-es en r-project.org Asunto: Re: [R-es] Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR Por definición
2013 Oct 02
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Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR
Efectivamente. Puedes cambiar el signo de todos los valores de la segunda componente, por ejemplo al hacer un gráfico de dispersión. No creo que se pueda hacer directamente en la función. Saludos Francesc El 01/10/13 17:53, Argel Gastélum Arellánez ha escrit: > Hola Francesc, muchas gracias por tu respuesta. > > Entonces, si quisiera que las gráficas de los resultados de
2013 Oct 01
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Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR
Por definición la primera componente principal es una combinación lineal que maximiza la varianza de modo que si la componente 1 es el vector de coeficientes a, entonces, el vector -a también puede ser dicha componente. Las otras componentes, por ejemplo la segunda, es incorrelacionada con la primera y también maximiza la varianza, luego el signo no importa. Así pues, el signo de cada
2013 Aug 27
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Encontrar las variables más importantes en componentes principales
Hola compañeros de la lista. Qué tal. Tengo un análisis de componentes principales, en el que se evalúan aproximadamente 1000 variables. Usando la función dudi.pca e inertia.dudi obtengo una cantidad de información sobre la influencia de las variables sobre los dos componentes principales. Me gustaría saber si existe alguna función que sobre esta información me arrojara la lista de
2013 Aug 29
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Resumen de R-help-es, Vol 54, Envío 22
Hola! No he podido consultar la doc. del paquete ade4, algo debe estar caído en CRAN ahora mismo. Dos cosas sobre la metodología -aun desconociendo los detalles de cómo lo hace ade4: El output de un PCA, los "pesos" de cada variable en las dimensiones de los componentes se interpretan como correlaciones, a mayor valor absoluto mayor asociación variable-componente. Ahora, como tales
2008 May 29
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plotting zoo using datetime as xlim
is there a way to use the actual index value for plotting zoo objects this is the way that the index is set up and a sample range of what I would like to plot 01/01/06 00:00:00 - 01/01/06 23:45:00 { library(zoo) # chron library(chron) fmt.chron <- function(x) { chron(sub(" .*", "", x), gsub(".* (.*)", "\\1:00", x)) }} x <- structure(c(15.57, 15.5,
2013 Aug 29
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Encontrar las variables más importantes en componentes principales
Hola Argel, Puedes encontrar un par de ejemplos que cómo conseguir una valoración (qualitativa y cuantitativa) de la contribución de cada variable a cada componente principal, en el libro "Exploratory Multivariate Analysis by Example Using R". Este libro está basado en la librería "FactoMineR". Los ejemplos están en el capítulo primero. No he mirado como se haría esto con
2009 Sep 24
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pregunta $
una pregunta aun no comprendo totalmente el uso del signo $, me podrian decir donde encuentro su significado (si, si ya se que significa dinero y eso.........) desde el punto de vista de R gracias fabian huerta Yahoo! Cocina Encontra las mejores recetas con Yahoo! Cocina. http://ar.mujer.yahoo.com/cocina/ [[alternative HTML version deleted]]
2016 Jul 25
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Duda sobre construccion de vectores
Hola buenas tardes comunidad, seguro que hay algo fácil, pero se me escapa y es que estoy hoy algo torpe seguramente, a ver me gustaría hacer lo siguiente: Dada una matriz M (que puede ser muy grande), me gustaria crear un vector, sin usar bucles (ya que cuando es muy grande, todo puede ser muy lento) del siguiente modo. Para cada una de sus filas, me gustaría seleccionar un único elemento de una
2011 Apr 01
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Predicción de valor máximo en superficie de respuesta, con paquete rsm
Hola compañeros de la lista. Estoy aprendiendo a usar el paquete "rsm" para superficies de respuesta. Siguiendo este ejemplo todo va bien, hasta que trato de obtener el valor máximo predicho para la variable de respuesta en los valores de x1 y x2 estimados. ------------------------------------------------------------- library("rsm") ChemReact CR <- coded.data(ChemReact,
2013 Jul 23
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Comparación entre dos DL50's
Hola compañeros de la lista. Tengo el análisis que muestro abajo, para la estimación de la Dosis Letal Media (DL50) por medio de regresión logística, de dos compuestos similares (denominados 1 y 2) aplicados a grupos de individuos similares, evaluando el número de individuos vivos y muertos al final del ensayo. Mi duda es qué forma me recomiendan para determinar si la diferencia es
2012 Mar 16
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Cosinor
Hola, ¿qué tal?: Tengo la siguiente duda: Para el caso del Cosinor Simple: Y = M + A * cos(2*pi*t/T + phi) + error Cuando T conocido, podemos asumir: Y = M + beta * X1 + gamma * X2 + error, siendo X1 = cos(2*pi*t/T) y X2 = sin(2*pi*t/T) En este caso (Cosinor simple) el modelado lo llevo a cabo del siguiente modo: lm( y ~ X1 + X2) Para el caso de componentes múltiples: Y = M + ?Aj *
2018 Apr 18
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Interpretar intercepto de modelo ZINB
Buenas tardes, ¿Cómo interpretarías el intercepto que da R en un modelo de ceros inflados? Por un lado en la parte de conteo tengo un intercepto de -4.2 y en la parte de ceros de 102, ambos salen significativos (***). ¿Qué me dirían? Gracias
2011 Aug 10
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anova medidas repetidas con lme
Hola compañeros de la lista. Tengo el siguiente set de datos: Repeticiones <- c(rep("RI", 14), rep("RII", 14), rep("RIII", 14)) Tiempo <- rep(c(0, 2, 4, 6, 8, 10, 12, 24, 36, 48, 60, 72, 96, 120), 3) Concentracion_celular <- c(0.4862, 0.5375, 0.4309, 0.4390, 0.4603, 0.4733, 0.3936, 0.9085, 0.5838, 0.5477, 0.6331, 0.8693, 1.0092, 0.6341, 0.5350,
2010 Sep 23
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Contraste polinomial con dos factores con niveles no equidistantes
Hola compañeros de la lista, qué tal. Los molesto con la siguiente duda: Tengo un experimento con dos factores A y B, cada uno de los cuales tiene los siguientes niveles (que son concentraciones de dos hormonas vegetales aplicadas a plantas): niveles del factor A: 0, 0.2, 0.5, 1 niveles del factor B: 0, 0.1, 0.2, 0.5, 1 y mi variable de respuesta es continua, todo dentro del set de datos
2016 Jul 25
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Duda sobre construccion de vectores
Creo que me puede valer, muchas gracias Jorge, voy a probarlo y te cuento From: jorgeivanvelez en gmail.com Date: Mon, 25 Jul 2016 12:05:05 -0500 Subject: Re: [R-es] Duda sobre construccion de vectores To: fjroar en hotmail.com CC: r-help-es en r-project.org Buenas tardes, Francisco. Quizás no sea la manera mas eficiente, pero proporciona el resultado que buscas: R> M <-
2012 May 01
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Coeficiente de determinación - Contribución parcial
  Buenos días:   Antes de nada, disculpadme por ocuparos tiempo en el día del trabajador...   Hace unos días o semanas pregunté acerca de cómo calcular la contribución parcial de una componente al Multiple R-squared que devuelve lm.   En su momento Carlos Ortega me informó acerca de varias opciones (ols, regsubsets,... e incluso me referenció un libro). El caso es que por ninguna de las vías he
2011 Nov 05
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testing significance of axis loadings from multivariate dudi.mix
Hi all I?m trying to tests the significance of loadings from a ordination of 46 variables (caategorical, ordinal and nominal). I used dudi.mix from ade4 for the ordination. A years ago Jari Oksanen wrote this script implementing Peres-Neto et al. 2003 (Ecology) bootstraping method: netoboot <- function (x, permutations=1000, ...) { pcnull <- princomp(x, cor = TRUE, ...) res
2009 Nov 24
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extraer un valor de un objeto lmer
> > Hola, a todos! Estoy ajustando un modelo componentes de varianza utilizando el paquete lme4, quiero extraer luego los valores estimados de varianza de cada factor aleatorio de este objeto lmer y guardarlo en un vector. Existe la función VarCorr, Esto es lo que hago: Mi ejemplo: tengo 3 factores NDVIaño; Máx.IH; TV # Ajusto el modelos lmer(peligro100 ~ 1 + (1|NDVIaño) + (1|Máx.IH) +
2009 Jan 24
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Help with dudi.pca
Dear R-helpers, I have two data frames, op and em4: > str(op) 'data.frame': 37 obs. of 5 variables: $ m : num 0.202 0.336 0.122 0.139 0.14 ... $ lln : num 0.798 0.643 0.863 0.835 0.823 ... $ rrn : num 0.789 0.702 0.894 0.895 0.923 ... $ asym2: num 0.177 0.304 0.108 0.187 0.274 ... $ asym3: num 0.0755 0.0975 0.0818 0.0651 0.13 ... > str(rownames(op)) chr