similar to: Valores faltantes en SVM aplicado a microarrays

Hola a todos La cuestión es una tontería, me gustaría recodificar los NA (valores faltantes) por el valor 0 He probado varias cosas del estilo: > hh<-c(2,3,4,NA,4) > replace(hh,which(hh==NA),0)->hh > hh [1] 2 3 4 NA 4 Conocéis alguna forma. Saludos

?El considerar las horas, minutos y segundos, depende de lo que quieras hacer. - Puedes incorporarlo en el campo fecha con la función de lubridate: "ymd_hms()". - Pero luego al crear el vector de referencia para encontrar los faltantes tienes que crear un vector secuencia entre la fecha mínima y la máxima. Este vector de referencia no tiene dudas de que es entre el max y

Buen día para todos. Tengo un pequeño problema en el quisiera que me colaboraran. Estos días estoy trabajando en la lectura de una gran cantidad de archivos de extención .csv, se trata de una lista de documentos de 11 estaciones meteorologicas. Cada estación esta clasificada por meses y cada mes por dias, asi que tengo un archivo cada día. Por ejemplo tengo un archivo .csv para el día uno del

Hola. Una manera puede ser tomar una lista de todos los archivos de un directorio y trabajar con ellos, puesto que ciertamente existen. ¿Cómo? Supongamos que tienes una carpeta llena de archivos csv. Entonces, puedes guardar el nombre de tus archivos en un objeto con lista_archivos<-dir() > y esto te dará todos los csv de esa carpeta (si tienes otros archivos también estarán allí, pero

Hola, estoy intentando hacer un Tukey post test y no me lo permite. Hice el anova con aov sin problemas, pero al hacer el Tukey, me dice: > TukeyHSD(ANOVAGalMan3,Sample*`Purification-step`,ordered = TRUE)Error in `[.data.frame`(mf, mf.cols[[i]]) : undefined columns selected aclaro que ANOVAGalMan3 es el resultado de anova. la tabla origen tiene la estructura: Sample Purification-step

Buenas noches. Quisiera saber si existe una libreria o función que me calcule el área bajo la curva de dos vectores de números. Ademas esta debe tener en cuenta si existen datos faltantes o NaN. Por ejemplo calcular el área bajo la curva del vector en el eje x: x<- c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10) y el vector en el eje y: y<-c(0,2,15,30,50,NaN,NaN,10,2,1) Muchas gracias. -- *Wilmer

Hi, I need fit the France model : y = A{1 - exp[-b(t-T) - c(sqrt(t) - sqrt(T))]} parameters: A, b, T, c variable: t (time) resp: y I tried: time = 1:48 resp = rnorm(48, 200, 10) dados = data.frame(resp, time) attach(dados) f = function(x, A, b, T, c) A*(1-exp(-b*(x-T) - c*(sqrt(x) - sqrt(T)))) (mod1 = nls(resp~f(time, A, b, c, T), data=dados, start=c(A=500, b=152, c=100,

Buenas tardes Les consulto los siguiente, dentro de unos datos hay registros faltantes, estos son NA. Me gustaría poder avisar cuáles son los registros no tomados en cuenta porque son NA. Como no puedo reproducir el error, copio y pego un script R que es la forma que yo razone, la cuál me funciona, y un trozo de la captura de pantalla donde aparece mi error, es decir todo NA. # NA's

COD.EST VARIABLE AÑO DIA ENERO FEBRERO MARZO ABRIL MAYO JUNIO JULIO AGOSTO SEPBRE OCTUBRE NOVBRE DICBRE 1 2501001 PT 1986 1 NaN NaN NaN NaN 2.0 .0 .0 9.0 NaN NaN NaN NaN 2 2501001 PT 1986 2 NaN NaN NaN NaN .0 11.0 19.0 .0 NaN NaN NaN NaN 3 2501001 PT 1986 3 NaN NaN NaN NaN 11.0 3.0 .0 .0 NaN NaN

Estimado Wilmer Contreras Sepulveda Me parece buena la sugerencia de Jorge, hay muchas formas, yo aparte de la sugerencia que le hicieron le agrego otras dos, en cualquier buscador las palabras claves son R AUC, y el artículo https://www.r-bloggers.com/calculating-auc-the-area-under-a-roc-curve/ , lógicamente aparecerán tantas alternativas que puede llegar a confundirse respecto a cuál es

Estimado Andres Hirigoyen Lo que comenta Carlos Ortega es una buena opción, yo la use, pero me crea una duda, supongamos que compilo de la línea 50 a la 100 porque ahí está la función, luego para aplicarla llamo a la función compilada y el proceso mejora, pero mi duda está en que el código que compile (el original) continúa estando al usuario, y este podría tocarlo y recompilar sin mucho

Me gusta la respuesta uqe has dado, pero si por ejemplo, alguno de los datos tiene datos faltantes, entonces devuelve NA. He probado con: sapply(split(datos$uno, as.factor(datos$dos)), mean(na.rm=TRUE)) pero da fallo. ¿Cómo se podría hacer para que devolviera además la media obviando los NA y que contara el numero de NA por categoria? > Date: Wed, 28 Oct 2015 00:13:45 +0100 > From: cof

Hola: Tengo un absoluto desconocimiento de las posibilidades que ofrece R desde el punto de vista web así que agradecería que alguien me ?encaminara? para un proyecto que me está rondando. El proyecto consistiría básicamente en montar una especie de formulario web al cual accederían distintas personas (colaboradores) repartidas por España. El formulario tendría una serie de datos precargados y

Estimados: Tengo problemas con mi programa R. Cada vez que dejo stand-by mi compu por unos minutos, R se queda pegado, e imposibilitado de trabajar, lo que me obliga a cerrarlo y volver a abrirlo cada vez que sucede. De: Carlos Ortega [mailto:cof en qualityexcellence.es] Enviado el: miércoles, 31 de agosto de 2016 3:49 Para: javier valdes CC: Javier Valdes Cantallopts (DGA); r-help-es en

Hola, Usé "textConnection" para poder utilizar tus propios datos y leerlos con read.table. En tu caso, si tienes los datos en un .csv, simplemente tienes que leerlos con read.table y utilizar la parte que sigue a "library(lubridate)" en el código que compartí ayer: coger la columna de fechas, leerla con "lubridate" y compararla con el vector de referencia. El error

Hola estimados. Alguien ha utilizado alguna vez el paquete IMPUTE_TS? La verdad es que es bastante recomendable, sin embargo hay un tema que no he podido resolver. El programa te entrega los resultados en la consola...sin embargo, la idea es rellenar los (N.A) del dataset ORIGINAL. La pregunta es: Cómo rellenar los (N.A) del dataset original si tengo los resultados en la consola? O como llevar

Como dice José normalmente son las cabeceras, (terminando en dev) . Para gtk prueba con sudo apt-get install libgtk2.0-dev Yo también estoy en ubuntu 13.10 y precisamente me pasó algo similar al instalar rgl, lo solucioné instalando libglu1-mesa-dev y algunas otras "dev". Saludos El 05/11/13 17:50, Carlos J. Gil Bellosta escribió: > Hola, ¿qué tal? > > Eso te dice que es

Dear All: Significance Analysis of Microarrays(SAM) As we know sam do multiple t.test as following ## Default S3 method: t.test(x, y = NULL, alternative = c("two.sided", "less", "greater"),mu = 0, paired = FALSE, var.equal = FALSE,conf.level = 0.95, ...) var.equal: a logical variable indicating whether to treat the two variances as being equal. If 'TRUE'

Dear useRs: I'm not sure if it's the correct place to ask but I'll try it out. I've been reading about how to perform Principal Component Analysis (PCA) in microarrays (see [1]) and there's something that I don't get it. Basically it's related with performing PCA over data sets which number of variables is greater than the number of samples. For example in the paper

I know that there are quite a few packages out that there for cluster analysis. The problem that I am facing is finding a package that will not incorporate all my samples into clusters but just the samples that fit a threshold (that I have not set yet and may need help finding the right level) for genotyping. It should be able to "no call" samples outside the clusters. It also needs to