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2009 Nov 02
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Optimizar código
Hola lista, tengo una base de datos muy grande de un datalogger. Consiste en un vector con 0's y 1's, y tengo que ver cuando hay 600 o más unos seguidos. Se me ocurrió hacerlo con un loop for. Pero tarda demasiado. También intente usar which para que seleccione solo los 1 para empezar a sumar pero no hay gran diferencia. A alguien se le ocurre alguna solución para hacerlo más rápido? Acá
2010 May 26
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regresion mixta
Hola a tod en s, estoy trabajando con modelos de regresión mixta con el paquete "nlme", concretamente con la función "lme". Una vez que hago mi modelo y el summary del mismo obtengo por ejemplo la significación (valor p) de la variable independiente, así como el valor del AIC para comparar mi modelo con otro similar, pero no sé cómo obtener un valor del grado de ajuste de la
2010 May 03
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toma de muestras
Buenas tardes a todos. Mi problema es el siguiente: Calculo una muestra de unos índices (s) y a partir de esa muestra elijo aquellos elementos de una tabla de datos que tengo (en este caso XP4) que cumplen la condición de que el índice de XYP sea el de la muestra. Ahora comienza mi problema, la única forma que he encontrado para que me R me tome todos los elementos que necesito es creando un
2012 Jul 22
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Duda acerca de "resetear" elementos de una lista
Hola:   Tengo una serie de funciones que he integrado formando un paquete, y dichas funciones manejan una lista global en la cual se alojan los parámetros de configuración del análisis, pero también los data.frame de resultados numéricos.   La pregunta es la siguiente: en cada análisis algunos data.frame de resultados se actualizarán pero otros no (si el usuario no activó ese análisis en
2010 Jul 26
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modelos mixtos con familia quasibinomial
Hola a tod en s, mi compañero y yo intentamos ver la correlación de nuestros datos mediante regresiones logísticas. Trabajamos con proporciones (1 variable dependiente y 1 independiente) mediante modelos mixtos (los datos están agrupados porque hay pseudoreplicación). Hemos usado el paquete "lme4" y la función "lmer". Encontramos "overdispersion" en el resultado
2011 Dec 12
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obtener variables desde un dataframe
Hola amigos de R en Español, Estoy eliguiendo unas variables desde una dataframe, pero cuando creo un objeto nuevo ( con cbind) las nueva tabla (que es una matriz) se pierden los nombres de los factores. Aparecen numeros (1,2,3..). Alguien me puede decir si existe un comando para extraer las variables a un nuevo dataframe, pero sin cambiar el nombre, ni la codificacion ? Gracias, José
2017 Nov 11
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effects package x axis labels
Dear All, probably a simple enough solution but don;t seem to be able to get my head around it...example based on a publicly available data set: mydata <- read.csv("https://stats.idre.ucla.edu/stat/data/binary.csv") mylogit <- glm(admit ~ gre + gpa + rank, data = mydata, family = "binomial") library(effects) plot(allEffects(mylogit) ? ?
2011 Aug 17
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contrast package with interactions in gls model
Hi! I try to explain the efffect of (1) forest where i took samples's soils (* Lugar*: categorical variable with three levels), (2) nitrogen addition treatments (*Tra*: categorical variable with two levels) on total carbon concentration's soil samples (*C: *continue* *variable) during four months of sampling (*Time:* categorical and ordered variable with four levels). I fitted the
2011 Feb 15
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editores en windows
Hola a todos. En linux uso rkward o gedit con el plugin Rgedit, pero me gustaría saber qué editores se pueden usar en windows. He probado Tinn-R , ¿qué usáis vosotros? Gracias
2010 Jun 17
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Problems using allEffects() (package effect)
Dear R users, I have some trouble using the allEffects() function to compute and display effect plots for a linear model. My data is quite simple, it concerns effects of 3 treatments on the tumoral volume of mice. vTum codes for the qualitative initial volume, from small to big, temps is the time in month since beginning of treatment, and S?rie codes for the batch. Data is unbalanced. >
2009 Feb 10
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Putting values and axis X labels on the charts based on allEffects
Dear everybody! Need help with graphics. I am runnig a simple lm and then using allEffects from 'effects' package: require(effects) model<-lm(Y~A+B, data=mydataframe) I am trying to build (for each predictor - A and then B) a plot of means on Y. I was successful doing it like this - in one swoop: ml.eff<-allEffects(ml1, se=F) plot(ml.eff,ylab="Title of Y") Is it
2010 Mar 09
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Help with adding points to allEffects plot
Thanks in advance for any help. I am attempting to add points to a plot using the allEffects command in the effects package. When I try to add the points I get the following error message: Error in plot.xy(xy.coords(x, y), type = type, ...) : plot.new has not been called yet Strangely, using the code I've pasted below this has worked for me in the past however figuring out what has
2009 Apr 28
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effects package --- add abline to plot
Hello, I am not having success in a simple task. Using the effects package, I would like to add reference lines at probability values of 0.1 – 0.6 on a plot of the effects. The plot command works, but following up with an abline command produces the message “plot .new has not been called yet”, and of course the reference lines were not added. Looking through past R help lists, there was a
2011 Jan 28
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Diferente escala en los ejes de un barchart
Buenos dias a todos. Tengo este Barchart con dos tipos de datos. Desembarcado y Muestreado. Como los datos de Desembarcado son mucho mayores que los de Muestreado, estos ultimos datos apenas si se aprecian en la grafica. Lo que se me ocurre es cambiar la escala de este eje. ¿alguien sabria como hacerlo? O alguna otra sugerencia claro. Muchisimas gracias a todos los que me estan ayudando Jose Luis
2012 Feb 04
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Comparaciones múltiples en ANOVA anidadp
Dispongo de un experimento en el que cinco tratamientos ha sido aplicados a cinco grupos de voluntarios. En cada grupo había tres personas y a cada persona se le tomaron 3 medidas, En total dispongo de 45 medidas, pero evidentemente no son independientes entre sí. Si no tomo en cuenta que las medidas de la misma persona son más parecidas entre sí (bloques anidados) estaría incurriendo en
2006 Apr 25
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lme: how to compare random effects in two subsets of data
Dear R-gurus, I have an interpretation problem regarding lme models. I am currently working on dog locomotion, particularly on some variation factors. I try to figure out which limb out of 2 generated more dispersed data. I record a value called Peak, around 20 times for each limb with a record. I repeat the records during a single day, and on several days. I tried to build two models, one
2008 Jul 17
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ATI Radeon 9600 was working once but not anymore....why ? :(
I have been using Mandriva 2008.0 regularly since last Jan so I'm not very good. I have Tomb Raider Anniversary (TRA )and although i had to remove all the graphic options everytime it loads i.e. vsync shadow reflection and water effects, i could play it and i was happy. After some time i had to stop because i had a problem with video codecs and i had to install/remove a lot of things to get
2010 May 04
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help overlay scatterplot to effects plot
I have a process where I am creating a effects plot similar to the cowles effect example. I would like to add the point estimates to the effects plot, can someone show me the correct syntax. I have included the "R" effects example, so you can show me the correct syntax. Thanks mod.cowles <- glm(volunteer ~ sex + neuroticism*extraversion, data=Cowles, family=binomial)
2010 Feb 09
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Missing interaction effect in binomial GLMM with lmer
Dear all, I was wondering if anyone could help solve a problem of a missing interaction effect!! I carried out a 2 x 2 factorial experiment to see if eggs from 2 different locations (Origin = 1 or 2) had different hatching success under 2 different incubation schedules (Treat = 1 or 2). Six eggs were taken from 10 females (random = Female) at each location and split between the treatments,
2011 Jan 20
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Error Message - "effects" package
Hi, I'm running R 2.11.1 on Windows 32-bit. I fitted a glm to a "large" data set with no problems (i.e., nothing is wrong with the created glm object). However, when I try to use the "effects" package to plot the effects I get the error message shown below. I get the same message if I try to plot a single effect. Any idea what could be wrong here? glm.eff <-