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2010 Feb 24
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how to label individuals with FactoMiner ?
Dear all, i'm trying to label specific individuals (supplementary ones) after a PCA with the FactoMiner package. There is not much details (possibilities?) in the R-help of the plot.pca function. There is indeed a "label" parameter but i could only manage to label the supplementary individuals with there "row.names" (i.e. label="indiv.sup") and not with the
2013 Oct 01
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Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR
Por definición la primera componente principal es una combinación lineal que maximiza la varianza de modo que si la componente 1 es el vector de coeficientes a, entonces, el vector -a también puede ser dicha componente. Las otras componentes, por ejemplo la segunda, es incorrelacionada con la primera y también maximiza la varianza, luego el signo no importa. Así pues, el signo de cada
2013 Nov 01
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FactoMineR
Este listado de antibióticos lo tengo en una tabla csv CON DETERMINADAS MEDICIONES CUANTITATIVAS POR AñOS Ampicillin Oxacillin Peniclina Ciprofloxacina Amikacina Gentamicina Kanamicina Ceftriaxone Ceftazidima Cefotaxima Cefazolina Cefuroxima Aztreonam Cloranfenicol Vancomicina Eritromicina Clindamicina Fosfomicina Amoxicilina Imipenem Azitromicina
2013 Oct 02
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Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR
Efectivamente. Puedes cambiar el signo de todos los valores de la segunda componente, por ejemplo al hacer un gráfico de dispersión. No creo que se pueda hacer directamente en la función. Saludos Francesc El 01/10/13 17:53, Argel Gastélum Arellánez ha escrit: > Hola Francesc, muchas gracias por tu respuesta. > > Entonces, si quisiera que las gráficas de los resultados de
2006 May 17
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PCA with FactoMiner
Hello! I want to do Principal Component Analysis With FactoMiner package in . My data has 923 observation and 12 quantitatives variables. In data frame is there no missing values but are there Zeros as observed values for some units of analysis. When i execute the function >PCA(testeff) is there one error: #error in V* poids: non-numeric argument to binary operator. Can anybody help?
2012 Aug 31
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loading 'RcmdrPlugin.FactoMineR' pachage in R
Hi everybody I have a question about loading 'RcmdrPlugin.FactoMineR' pachage in R. I have installed Rcmdr, FactoMineR and 'RcmdrPlugin.FactoMineR. when I want to load this package, at first a message inform me I should load the following list of packages: FactoMineR, ellipse, lattice, cluster, scatterplot3d, Rcmdr, tcltk, car, MASS, nnet I have loaded all above packages and again I
2013 Nov 17
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FactoMineR
Hola, El problema está con el nombre de las columnas y las filas del fichero que importas. Mira este detalle tras hacer la importación: > names(mort) [1] "X" "X15.24..79." "X25.34..79." [4] "X35.44..79." "X45.54..79." "X55.64..79." [7] "X65.74..79." "X75.84..79."
2018 Jul 12
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Imposible instalar FactoMineR (KUbuntu 18.04)
Buena tardes. La descripción es el asunto del mail y la salida que me da la siguiente: ``` * installing *source* package ?FactoMineR? ... ** package ?FactoMineR? successfully unpacked and MD5 sums checked ** R ** data ** inst ** preparing package for lazy loading Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : unable to load shared object
2013 Oct 01
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Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR
Instalo ade4 correctamente y no me abren los datos como por ejemplo data(bsetal97) ¿Qué piensan de eso? De: r-help-es-bounces en r-project.org [mailto:r-help-es-bounces en r-project.org] En nombre de Francesc Carmona Enviado el: Tuesday, October 01, 2013 7:30 AM Para: r-help-es en r-project.org Asunto: Re: [R-es] Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR Por definición
2013 Jan 22
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FactoMineR
Dear Users, I installed R Commander and the FactoMineR plug-in. Everything is fine, I can see the new menu, I can import datasets, but if I want to use any of the items in the FactoMineR menu, i get the following error: Error in get(.activeDataSet) : object '.activeDataSet' not found even if there is an active dataset (if there is none, all the menu items are grey of course). I have R
2018 Jul 12
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Imposible instalar FactoMineR (KUbuntu 18.04)
Gracias, Carlos. Lo voy a tener que revisar con ahínco. Lo había visto, pero no entendido. A ver si va por ahí el problema 2018-07-12 16:52 GMT+02:00 Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es>: > No es la versión de la librería con la que tienes tú el problema... pero > puede ayudar... > > https://stackoverflow.com/questions/47608240/lavaan- >
2013 Nov 17
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FactoMineR
Hola. Como te dijo Carlos, el problema está en los nombres de las columnas y en los nombres de las filas. Cuando hice la importación (con dd<-read.csv('mortality.csv'), tuve problemas con las filas de nombre: - Malignant tumour of the larynx trachea bronchus and lungs - Malignant tumour of the lip pharynx and mouth - Other endocrinological metabolic and nutritional conditions
2013 Nov 17
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FactoMineR
Estimados Queremos con el paquete FactoMineR hacer este tipo de tabla de mortalidad que lea los datos desde de una tabla csv Realizamos lo que viene en la ayuda y es muy interesante, sin embargo cuando mandamos a leer desde la tabla csv original de los autores no hace el análisis porque algo falta y no nos percatamos de que es. Adjunto tabla original Saludos cordiales #ESTO ES LO QUE
2013 Apr 02
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R Commander and FactoMineR
Dear Users, I helped to install R Commander and FactoMineR to one of my collegaues. He wanted to do an MCA. Selecting three variables and using the default settings results in only one graph, the variables representation, where he gets three points for the three variables (which is totally fine). Running the code (output of the point-and-click method) EuTop100.MCA<-EuTop100[,
2008 May 03
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factor analysis for binary data with FactoMineR package
Hi List, I'm following on the discussions regarding the use of exploratory factor analysis with binary data, from nabble: http://www.nabble.com/PCA--for-Binary-data-to11050371.html#a11092127 and i tried using FactorMineR package but unfortunately i have trouble understanding what are the types of the variables which AFDM is suitable for? I guessed from that example in ?AFDM that
2013 Oct 01
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Análisis de componentes principales con ade4 y FactoMineR
Hola compañeros de la lista, qué tal. Estoy haciendo un análisis de componentes principales utilizando las funciones "dudi.pca" (paquete "ade4") y "PCA" (paquete "FactoMineR"). Sucede que al comparar las coordenadas de cada individuo que obtiene cada función, las que corresponden al segundo componente principal tienen idéntica magnitud pero con
2013 Dec 17
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Polychoric Principal Component Analysis (pPCA)
I have data set with binary responses. I would like to conduct polychoric principal component analysis (pPCA). I know there are several packages used in PCA but I could not find one that directly estimate pPCA and graph the individuals and variables maps. I will appreciate any help that expand these reproducible scripts. #How to conduct polychoric principal component analysis pPCA using #either
2013 Nov 03
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CONSULTA f
ESTE SCRIPT FUNCIONA PERFECTAMENTE, LA PREGUNTA QUE HACÍA SE REFERÍA A QUE SI SERÍA POSIBLE QUE EN LA PROPIA TABLA CSV PUDIERAN ESTAR LOS NOMBRES DE LOS ANTIBIOTICOS Y QUE EL ANÁLISIS PCA NO LO RECHACE POR SER CUALITATIVO, QUE DE ALGUNA MANERA SE DIERA UNA INSTRUCCIÓN PARA EVITAR TENER QE HACER LO DE rownames manualmente setwd("D:/Public/Documents/R/FactoMineR/") table1 <-
2011 Aug 26
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Save figure in pdf
Hi, I created a figure with R and I want to save it in .pdf. I used this code: > pdf("res.pca.pdf",width=10,height=8) > library(FactoMineR) > res.pca<-PCA(acp) > res.pca > dev.off() When I go in my folder, I find an empty file ( 0 Ko). Do you know where is the problem. Thank you in advance -- View this message in context:
2013 Dec 05
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AYUDA CON ERROR CON LA LIBRERIA PCA
Estimados Al leer este interesante script lo corrí, pero al hacer la elipse me devuelve esa información, no encuentro el porque saludos library(FactoMineR) eu60<- read.csv(file.choose(), header=T, sep=";", dec=".", row.names=1) eu60.pca <- PCA(eu60, quali.sup=19) eu60.data <- cbind.data.frame(eu60[,19], eu60.pca$ind$coord) eu60.ellipse <-